Zbudowany z drzewa modrzewiowego w XVIII w. dla parafii Niegowić koło Bochni. Przeniesiony do Mętkowa w 1973 roku. Poświęcenia kościoła w Mętkowie dokonał w dniu 1 maja 1974 r. Ks. Kardynał Karol Wojtyła, Metropolita Krakowski, który w tymże kościele w Niegowici pełnił funkcję wikariusza w latach 1948-1949.